Plateforme analytique (2016-2017)


La plateforme analytique comporte notamment une plateforme de métabolomique englobant les domaines de la physiologie végétale, de l’agronomie, de la génétique, du génie des procédés, et de la santé humaine (prévention des maladies métaboliques et cardio-vasculaires). L’ambition est de nous doter d’un outil analytique de pointe et partagé pour étudier les liens entre systèmes de production/techniques de production/terroirs et signatures métaboliques, d’une part, et entre signatures métaboliques et effets biologiques, d’autre part. Nous avons la volonté, en coordination avec l’UMR NORT de Marseille en particulier, d’aboutir à la constitution d’une plateforme de métabolomique régionale sur le modèle de la plateforme Corsaire du Grand Ouest.

L’objectif prioritaire est d’étudier les propriétés des produits naturels d’origine végétale dans la plante, l’aliment et chez l’humain. Dans ce but, la plateforme permettra d’identifier et de quantifier les différents constituants de produits végétaux (extraits de plantes valorisables dans les industries agro-alimentaire, pharmaceutique et cosmétique, produits alimentaires frais ou transformés) et autres systèmes complexes (fluides et tissus biologiques) à la recherche notamment de produits dérivés et métabolites potentiellement bioactifs produits au cours des procédés d’extraction, transformation, digestion…

Cette plateforme doit pouvoir assurer un débit d’analyse élevé pour satisfaire non seulement aux besoins de la recherche mais aussi aux besoins en amont des producteurs et en aval des industriels et permettre ainsi de suivre la composition d’un produit tout au long de la chaîne d’élaboration d’un produit.

La plateforme comprend :

  • des outils d’analyse de techniques séparatives couplées à des détecteurs variés pour l’identification et la quantification de molécules volatiles et non volatiles avec un temps d’analyse significativement réduit ;
  • un équipement de purification permettant d’isoler des molécules d’intérêt particulier à l’échelle préparative ;
  • un procédé de conditionnement par atomisation permettant la formulation d’ingrédients pour une valorisation facilitée dans l’industrie ;
  • des outils d’analyse structurale permettant la caractérisation de systèmes colloïdaux variés (micelles, liposomes, agrégats, émulsions…) ;
  • un appareil de Résonance Paramagnétique Electronique, permettant l’analyse d’espèces radicalaires pour l’étude du stress oxydant et des mécanismes d’action des antioxydants ;
  • un microscope électronique à transmission doté d’une plate-forme d’observation cryogénique. Le matériel existant au sein de l’INRA d’Avignon (Unité de Pathologie végétale, domaine Saint Maurice, Montfavet), obsolète, ne permet pas l’observation d’un grand nombre de cellules, cette limitation constituant un frein important à son utilisation par des laboratoires industriels (des semenciers en particulier très demandeurs) et par les équipes de recherche de l’INRA et de l’Université d’Avignon ;
  • un appareillage de microscopie confocale autorisant la détection subcellulaire de protéines avec une très bonne résolution du fait de l’élimination du signal parasite des autres plans, la colocalisation de marqueurs fluorescents et l’acquisition de séries optiques permettant la reconstruction en 3D d’une cellule ou d’un tissu vivant. Cette technique qui permet de travailler sur des échantillons vivants au plus près de la réalité tissulaire et cellulaire est devenue incontournable pour illustrer des phénomènes dynamiques de métabolisation.
ÉquipementsMontant initial programméPrévu en
TOTAL2 308 k€
HPLC semi-préparative avec détecteur de masse quadripolaire + GC-TOF-MS300 0002016
(PROMET)
Ultra Performance Liquid Chromatography (UPLC) + détecteurs MS MALDI & QTOF500 0002016
UPLC + détecteur MS Triple Quad275 0002017 ou 2018
GC + détecteurs MS & FID + passeur d’échantillons multi-modes130 0002017 ou 2018
Système de purification CombiFlash + détecteurs UV & MS140 0002017 ou 2018
Chromatographie de Perméation de Gel + détecteurs multiples MALLS/RI/UV/DLS140 0002017 ou 2018
Appareil de résonance paramagnétique électronique143 0002017 ou 2018
Microscope Electronique à Transmission avec porte‐objet refroidi Gatan350 0002017 ou 2018
Microscope Optique Confocale Domaines UV‐visible‐proche IR330 0002017 ou 2018
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